Publications

ПУБЛИКАЦИИ

A model for diffusion of camp molecules

Модель диффузии молекул сAMP

A model for diffusion of camp molecules

1988

Biological membranes

1988

Биологические мембраны

1988

Biological membranes

V. 5, № 3, 308-312

V. 5, № 3, 308-312

Abstract

Abstract

АННОТАЦИЯ

АННОТАЦИЯ

In voltage-clamp experiments, one can measure ionic current induced by intracellular cAMP injection. This cAMP-current is assumed to be connected with a neuron membrane Na+ and K+ permeability change. As cAMP molecules diffuse from the injection point, they activate the protein kinase uniformly distributed over the neurone volume. The cAMP effect is induced by direct interaction with the cell cytoskeleton and not by usual phosphorylation of membrane proteins. The model proposed in this paper may be useful in investigations on the mechanism of membrane permeability control by a reaction-diffusion intracellular system. Excellent agreement of theoretical and experimental results makes possible the determination of exact values of membrane permeability change gNa and gK for predicting the neuron behavior in the state of pulse activity.

Метод фиксации потенциала на мембране нейрона позволяет измерить ионный ток возникающий в ответ на внутриклеточную инъекцию сАМР. Предполагается, что такой ток связан с изменением проницаемости мембраны нейрона для ионов натрия и калия. Молекулы сАМР диффундируют от места инъекции и взаимодействуют с протеинкиназой, распределенной равномерно по всему объему нейрона. Эффект сАМР вызван непосредственным взаимодействием с цитоскелетом клетки, а не фосфорилированием белков мембраны. Предлагаемая модель позволяет исследовать механизм управления изменением проницаемости мембраны реакционно-диффузионной системой клетки. Совпадение теоретических и эксперимрнтальных результатов дает возможность определить точные значения изменения проницаемости мембраны gNa gK и использовать их для предсказания поведения нейрона в режиме генерации.

Метод фиксации потенциала на мембране нейрона позволяет измерить ионный ток возникающий в ответ на внутриклеточную инъекцию сАМР. Предполагается, что такой ток связан с изменением проницаемости мембраны нейрона для ионов натрия и калия. Молекулы сАМР диффундируют от места инъекции и взаимодействуют с протеинкиназой, распределенной равномерно по всему объему нейрона. Эффект сАМР вызван непосредственным взаимодействием с цитоскелетом клетки, а не фосфорилированием белков мембраны. Предлагаемая модель позволяет исследовать механизм управления изменением проницаемости мембраны реакционно-диффузионной системой клетки. Совпадение теоретических и эксперимрнтальных результатов дает возможность определить точные значения изменения проницаемости мембраны gNa gK и использовать их для предсказания поведения нейрона в режиме генерации.

In voltage-clamp experiments, one can measure ionic current induced by intracellular cAMP injection. This cAMP-current is assumed to be connected with a neuron membrane Na+ and K+ permeability change. As cAMP molecules diffuse from the injection point, they activate the protein kinase uniformly distributed over the neurone volume. The cAMP effect is induced by direct interaction with the cell cytoskeleton and not by usual phosphorylation of membrane proteins. The model proposed in this paper may be useful in investigations on the mechanism of membrane permeability control by a reaction-diffusion intracellular system. Excellent agreement of theoretical and experimental results makes possible the determination of exact values of membrane permeability change gNa and gK for predicting the neuron behavior in the state of pulse activity.

chaimatics

Chaimatics

Discovery of links between the biology, physics and mathematics, and founding a new area of studies focused on computations in living systems are his life achievements. Efim Liberman gave the name of “Chaimatics” to this new area of science

I

DNA is the text of a code written for molecular computers of living cells. The notion of “Text” is intrinsically opposite to a random sequence of symbols, and it can exist only inside the system of language. In this case, it is a genetic language, which is isomorphic to a natural language

II

Computations conducted in a living cell are real physical actions, and free energy and time must be spent for completing them. As all living organisms are comprised of cells, this statement is applicable to any control processes implemented in the biosphere

III

Molecular computations are limited by the microscopic scale of a cell and inevitable impact of the computations on formulation of a problem begin solved. The Chaimatics grew from the recognition of the computation reality as the quantum mechanics grew from the recognition of the measurement reality.

IV

A cell creates а quantum computing tool for solving complex problems. This tool utilizes hypersound quanta, and uses the cell cytoskeleton as the computing environment. In such a computer, a price of elementary computation converges to the physical limit, which is Planck’s constant

Chaimatic's statements are simple, but they require a change in the traditional vision, rooted in scientific practice

Read a book

Chapter I

The journey of life in science

chaimatics

хаиматика

хаиматика

Итогом жизни в науке стало установление связей между биологией, физикой, математикой и новая область исследования, посвященная вычислениям в живых системах. Ефим Либерман дал имя новой науке: «Хаиматика»

I

ДНК – это текст программы для молекулярных компьютеров клеток. «Текст» по определению не случайная последовательность знаков и может существовать только внутри языковой системы. В данном случае это генетический язык, изоморфный естественному языку

II

Вычисление в живой клетке является реальным физическим действием и требует затрат свободной энергии и времени. Поскольку все живые организмы состоят из клеток, это относится ко всему управлению, которое осуществляется в биосфере

III

Молекулярные вычисления ограничены микроскопическим объемом клетки и принципиальной возможностью влияния вычисления на условия решаемой задачи: квантовая механика возникла из осознания реальности измерения, Хаиматика - из реальности вычисления

IV

Для решения сложных задач клетка создает устройство квантового вычисления, использующего кванты гиперзвука и клеточный цитоскелет, как вычисляющую среду. Цена вычисления в таком компьютере стремится к физическому пределу – постоянной Планка

Утверждения Хаиматики просты, но они требуют изменения традиционных представлений, принятых в научной практике

Читать книгу

Глава I

Как все начиналось

хаиматика