Publications

ПУБЛИКАЦИИ

The kinetics of the cAMP interaction with protein kinase and the neuronal membrane response to cAMP injection

Кинетика взаимодействия сAMP с протеинкиназой и ответ мембраны нейрона на инъекцию сAMP

The kinetics of the cAMP interaction with protein kinase and the neuronal membrane response to cAMP injection

1989

Biological membranes

1989

Биологические мембраны

1989

Biological membranes

V. 6, № 7, 749-753

V. 6, № 7, 749-753

Abstract

Abstract

АННОТАЦИЯ

АННОТАЦИЯ

The calculation shows that the delay observed on cAMP injection by iontophoretic current is related to the deviation of the cAMP and protein kinase interaction from the classical Michaelis-Menten scheme. Some types of cAMP interaction with the regulatory subunit of protein kinase are studied. A comparison of modeling with experimental data shows that the kinetics of this reaction is described by a power function, which corresponds to the presence of several cAMP binding sites on the holoenzyme.

С помощью расчета показано, что задержка, наблюдаемая при ионофоретическом введении сАМР, связана с тем, что реакция взаимодействия сАМР с протеинкиназой отличается от классической схемы Михаэлиса - Meнтен. В работе исследовано несколько типов реакции взаимодействия сАМР с регуляторной субъединицей протеинкиназы. Сопоставление результатов моделирования с данными эксперимента показало, что кинетика такой реакции описывается степенной функцией. Это соответствует наличию нескольких центров связывания сАМР на холоферменте.

С помощью расчета показано, что задержка, наблюдаемая при ионофоретическом введении сАМР, связана с тем, что реакция взаимодействия сАМР с протеинкиназой отличается от классической схемы Михаэлиса - Meнтен. В работе исследовано несколько типов реакции взаимодействия сАМР с регуляторной субъединицей протеинкиназы. Сопоставление результатов моделирования с данными эксперимента показало, что кинетика такой реакции описывается степенной функцией. Это соответствует наличию нескольких центров связывания сАМР на холоферменте.

The calculation shows that the delay observed on cAMP injection by iontophoretic current is related to the deviation of the cAMP and protein kinase interaction from the classical Michaelis-Menten scheme. Some types of cAMP interaction with the regulatory subunit of protein kinase are studied. A comparison of modeling with experimental data shows that the kinetics of this reaction is described by a power function, which corresponds to the presence of several cAMP binding sites on the holoenzyme.

chaimatics

Chaimatics

Discovery of links between the biology, physics and mathematics, and founding a new area of studies focused on computations in living systems are his life achievements. Efim Liberman gave the name of “Chaimatics” to this new area of science

I

DNA is the text of a code written for molecular computers of living cells. The notion of “Text” is intrinsically opposite to a random sequence of symbols, and it can exist only inside the system of language. In this case, it is a genetic language, which is isomorphic to a natural language

II

Computations conducted in a living cell are real physical actions, and free energy and time must be spent for completing them. As all living organisms are comprised of cells, this statement is applicable to any control processes implemented in the biosphere

III

Molecular computations are limited by the microscopic scale of a cell and inevitable impact of the computations on formulation of a problem begin solved. The Chaimatics grew from the recognition of the computation reality as the quantum mechanics grew from the recognition of the measurement reality.

IV

A cell creates а quantum computing tool for solving complex problems. This tool utilizes hypersound quanta, and uses the cell cytoskeleton as the computing environment. In such a computer, a price of elementary computation converges to the physical limit, which is Planck’s constant

Chaimatic's statements are simple, but they require a change in the traditional vision, rooted in scientific practice

Read a book

Chapter I

The journey of life in science

chaimatics

хаиматика

хаиматика

Итогом жизни в науке стало установление связей между биологией, физикой, математикой и новая область исследования, посвященная вычислениям в живых системах. Ефим Либерман дал имя новой науке: «Хаиматика»

I

ДНК – это текст программы для молекулярных компьютеров клеток. «Текст» по определению не случайная последовательность знаков и может существовать только внутри языковой системы. В данном случае это генетический язык, изоморфный естественному языку

II

Вычисление в живой клетке является реальным физическим действием и требует затрат свободной энергии и времени. Поскольку все живые организмы состоят из клеток, это относится ко всему управлению, которое осуществляется в биосфере

III

Молекулярные вычисления ограничены микроскопическим объемом клетки и принципиальной возможностью влияния вычисления на условия решаемой задачи: квантовая механика возникла из осознания реальности измерения, Хаиматика - из реальности вычисления

IV

Для решения сложных задач клетка создает устройство квантового вычисления, использующего кванты гиперзвука и клеточный цитоскелет, как вычисляющую среду. Цена вычисления в таком компьютере стремится к физическому пределу – постоянной Планка

Утверждения Хаиматики просты, но они требуют изменения традиционных представлений, принятых в научной практике

Читать книгу

Глава I

Как все начиналось

хаиматика